Les partenaires de la Cour sont les suivants :
Au niveau national, les parties prenantes de la Cour des Comptes sont d’ordre institutionnel (l’exécutif, le législatif et le judiciaire), non institutionnel (les médias, les organisations de la société civile, les citoyens).
Au niveau panafricain et international, les partenaires de la Cour des Comptes du Togo sont d’abord les associations professionnelles d’institutions internationales de contrôle des finances publiques que sont :
- la Cour des Comptes des Etats membres de l’Union Economique et Monétaire Ouest Africaine (UEMOA) ;
- l’Organisation Africaine des Institutions Supérieures de Contrôle des Finances Publiques (AFROSAI) ;
- le Conseil Régional de Formation des Institutions Supérieures de Contrôle des Finances Publiques de l’Afrique Francophone Subsaharienne (CREFIAF) ;
- l’Association Africaine des Hautes Juridictions Francophones (AA-HJF) ;
- l’Association des Institutions Supérieures de Contrôle ayant en Commun l’Usage du Français (AISCCUF) ;
- l’Organisation Internationale des Institutions Supérieures de Contrôle des Finances Publiques (INTOSAI) ;
- l’Initiative de Développement de l’INTOSAI (IDI).
A ces partenaires techniques et professionnels s’ajoutent les partenaires financiers que sont :
- la Banque Africaine de Développement (BAD) ;
- la Banque Ouest Africaine de Développement (BOAD) ;
- l’Union Européenne (UE) ;
- le Programme des Nations Unies pour le Développement (PNUD) ;
- la Banque Mondiale (BM) ;
- le Fonds Monétaire International (FMI)